保留完整版本變更歷程是版控系統的核心精神之一，檔案項目一旦簽入，就算使用者要求刪除，項目從清單上消失，仍可透過歷史記錄還原每一個曾簽入的版本。
實務上，偶爾會發生不慎誤將不該簽入內容丟上版控的狀況（例如：誤簽入個資或機密敏感內容），此時版控對保留完整軌跡的堅持變成缺點，不管刪除或 Rollback 都無法防止他人透過歷史記錄還原內容。
非常狀況只能用非常手段，在 TFS 上遇此種狀況，tf.exe 工具有個 destroy 指令可以解決問題。
語法範例如下：
tf destroy $/src/path/filename.ext /collection:"httq://tfs-server:8080/tfs/collectionName"
執行者必須具備 Team Foundation Administrators 管理者群組身分，確認刪除後檔案便會從 TFS 移除，從 Changeset、Pending Change、Merge History、Branch History 徹底消失，不留半點痕跡。參考
在 destroy 前，建議先依 TFS 標準做法將該項目刪除。否則可能出現類似下圖的奇特狀態，tfs-destroy-test.txt 已從 Source Controller Explorer 消失，但 Solution Explorer 裡它仍存在且有藍色鎖頭，按右鍵 View History 也能查詢，但查不到任何簽入簽出記錄。
若 destroy 時其他人更動過該檔案而處於 Pending Change（暫止變更）狀況，將出現如下警示：
此時可加上 /preview 參數，tf.exe 將不執行動作，只顯示檔案被哪些人列為 Pending Change。優雅的做法是通知相關人員自行 Undo 後再 destroy；粗暴一點直接刪除也成，該項目將從眾人的 Pending Change 清單消失，可能讓當事人一頭霧水以為撞鬼。
最後提醒，destroy 非正常操作，只能視為修補錯誤簽入動作的迫不得已手段，並有遺失修改歷程、破壞資料一致性的副作用，只能由管理者執行，但遇到不計代價必須抹除資料的情境，算是唯一解法。